石台县市场监督管理局共设9个内设机构（职能科室），股级建制。
1. 办公室
负责机关文电、信息、统计、信访、档案、保密、安全、会务、经费、财务及预决算、装备、基本建设、票证管理和国有资产管理等工作；负责对外联系、公务接待等工作；承担综合性调研、政务公开、督查督办、新闻宣传、舆情管理和新闻发布等工作。
2. 人事教育科
负责全系统的机构编制、人事管理、队伍建设、教育培训、离退休人员服务管理；负责机关和所属单位党群、监察、双拥和文明创建等工作。
3. 政策法规科
组织行政处罚案件听证工作；承办行政复议、应诉和赔偿有关工作；承担本系统行政执法监督、规范性文件起草、执法案件审核和法制宣传等工作；负责综合治理工作；指导直属机构、派出机构、所属事业单位行政执法工作。
4. 市场规范管理科
组织拟定和实施规范市场秩序的规章制度及具体措施；负责组织开展规范维护各类市场经营秩序工作及各类市场专项治理工作；承担监督管理经纪人、经纪机构及经纪活动工作，指导经纪人协会工作；承担商品交易市场信用分类管理工作；负责合同行政监督管理；承担管理动产抵押物登记、格式合同备案、拍卖行为有关工作；规范网络商品交易及有关服务行为，承担对网络经营主体的网络监测和巡查工作；负责计算机信息数据分析；承担信息咨询和信息化建设；负责安全生产综合管理和协调工作。
5. 质量认证监管科
组织实施质量振兴政策措施和政府质量奖励制度，推进名牌发展战略；承办产品、商品质量诚信体系建设有关工作；组织和参与有关产品、商品质量事故的调查；承担产品、商品防伪的监督管理工作；组织实施产品、商品质量安全强制检验、风险监控和监督抽查工作；负责纤维质量监督检查工作；监督管理产品、商品质量仲裁检验工作；实施有关产品、商品质量安全专项整治工作和打击假冒伪劣违法活动，组织实施缺陷产品、商品召回制度；负责认证、认可监督工作，负责对认证活动、认证产品、商品质量监督检查，依法对质量检验机构及相关社会中介组织进行监督管理；开展有关技术引进和新技术推广、科技转化等工作。
6. 企业监管科
指导和监督企业、农民专业合作社、个体工商户登记注册工作；负责企业、私营企业、个体工商户信用分类管理工作；指导个体民营企业协会工作；承担计划生育工作。
7. 商标广告监管科
依法对商标使用监督管理；组织查处商标侵权行为；依法保护驰名商标、著名商标、知名商标、地理标志商标、特殊标志和官方标志；负责地理标志产品保护工作；监督管理广告活动；承担监测各类媒介广告发布情况。
8. 标准计量科
组织实施标准监督；负责企业标准备案有关工作；负责商品条码管理工作；推行法定计量单位和执行国家计量制度；监督管理计量器具，组织量值传递和比对工作；监督管理商品计量、市场计量行为和组织计量仲裁检定；承担计量检定机构、社会公正计量机构及计量检定人员的资质管理工作。
9. 药化监管科
承担药品、医疗器械、化妆品的监督管理工作。